Résumé complet : En écologie microbienne, de nouvelles techniques de méta-omiques notamment celles du séquençage à haut débit proposent des outils de mesure et de diagnostic de la qualité microbiologique des sols. Les auteurs présentent les intérêts des micro-organismes, puis les techniques de méta-omiques (principes, méthodologies et applications), avant de préciser leur apport pour évaluer la qualité biologique des sols. Enfin ils annoncent des développements futurs. Ces nouvelles techniques sont illustrées par des exemples validés ou en cours de validation.