Résumé

Dans les années 2000, le RMQS (Réseau de Mesures de la Qualité des
Sols), avec 2 240 sites échantillonnés sur toute la France, a représenté une opportunité unique pour étudier les micro-organismes du sol sur de grandes échelles spatiales et ainsi développer un nouveau domaine scientifique : la biogéographie microbienne. Presque 20 ans après, cet article fait le bilan des connaissances qui ont été obtenues par l'application d'outils modernes de biologie moléculaire sur les sols du RMQS pour analyser l'abondance et la diversité des communautés microbiennes à l'échelle de la France. En plus des avancées fondamentales, ce bilan inclut les avancées finalisées qui ont permis de développer et de valider de nouveaux indicateurs microbiens de la qualité des sols et qui sont aujourd'hui directement opérables par les usagers du sol. Cette étude ne recouvre pas les sols urbains ; les perspectives de recherche en font néanmoins mention.